Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms