Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn19Q9ET38 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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