Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf3Q9ES30 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms