Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms