Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenofQ9ERR7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms