Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clstn2Q9ER65 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn2Q9ER65 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms