Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn12Q9ER56 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms