Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms