Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms