Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndst3Q9EQH7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms