Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ropn1lQ9EQ00 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms