Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms