Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn1Q9EPL2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms