Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a3Q9DCP2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms