Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan4Q9DCK3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tspan4Q9DCK3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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