Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn3Q9DCB1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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