Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms