Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr53Q9DB94 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms