Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg9Q9DB90 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms