Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc89Q9DA73 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms