Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Subh2bvQ9D9Z7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Subh2bvQ9D9Z7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Subh2bvQ9D9Z7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Subh2bvQ9D9Z7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Subh2bvQ9D9Z7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Subh2bvQ9D9Z7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms