Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd9Q9D9M4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms