Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9H8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9H8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9H8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms