Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntd1Q9D995 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntd1Q9D995 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms