Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms