Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hm13Q9D8V0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms