Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf2Q9D8U4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf2Q9D8U4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf2Q9D8U4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf2Q9D8U4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf2Q9D8U4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf2Q9D8U4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms