Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chp2Q9D869 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chp2Q9D869 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms