Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rep15Q9D7T1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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