Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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