Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms