Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc81Q9D5W4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms