Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn11Q9D572 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn11Q9D572 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms