Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms