Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms