Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms