Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms