Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf6Q9D4J7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms