Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhd1Q9D4J1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhd1Q9D4J1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms