Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms