Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms