Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clvs1Q9D4C9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms