Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syce1Q9D495 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms