Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap53Q9D439 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap53Q9D439 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap53Q9D439 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap53Q9D439 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap53Q9D439 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cfap53Q9D439 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms