Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms