Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms