Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrnp35Q9D384 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms