Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf128Q9D304 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms