Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D2Q3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms