Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms